La secuenciación masiva de ADN podría ayudar a detectar la trombosis


Un estudio coordinado por investigadores del Hospital Cl√≠nic-IDIBAPS, en colaboraci√≥n con investigadores del CIBER de Hepatica y Digestivas (CIBEREHD) y de Cancer (CIBERONC), ha demostrado que la t√©cnica ‘Next Generation Sequencing’, utilizada para la secuenciaci√≥n masiva de ADN, podr√≠a ser √ļtil para el manejo de la trombosis venosa espl√°cnica (TVE), ya que permite detectar alteraciones que no se encuentran mediante t√©cnicas convencionales.

Este estudio, publicado en el ‘Journal of Hepatology’, es el primero en haber utilizado esta t√©cnica en una gran cohorte de pacientes con TEV. Ha sido liderado por el responsable del grupo Regulaci√≥n de la microcirculaci√≥n hep√°tica en cirrosis y enfermedades vasculares hep√°ticas del IDIBAPS y l√≠der de grupo del CIBEREHD, Juan Carlos Garc√≠a-Pag√°n; por el titular del grupo de Neoplasias Mieloides del IDIBAPS, Francisco Cervantes, y Alberto √Ālvarez, del mismo grupo; y de la responsable del grupo Terapias experimentales en neoplasias linfoides del IDIBAPS y CIBERONC, Dolors Colomer; Marta Magaz, investigadora predoctoral del grupo liderado por la Dra. Garc√≠a-Pag√°n, fue la primera autora del art√≠culo.

El t√©rmino trombosis de la vena espl√°cnica (TVE) no cirr√≥tica y no tumoral engloba las enfermedades conocidas como s√≠ndrome de Budd-Chiari (BCS) y trombosis portal no cirr√≥tica. La causa subyacente m√°s com√ļn en ambas enfermedades son las neoplasias mieloproliferativas (NMP). Sin embargo, hasta en un 30 por ciento de los pacientes con TEV, no se encuentra una causa subyacente y se consideran de origen idiop√°tico.

‚ÄúNuestra hip√≥tesis se basa en el hecho de que una proporci√≥n de estos pacientes idiop√°ticos podr√≠an tener NMP / clonalidad hematopoy√©tica no diagnosticada por las t√©cnicas convencionales actualmente utilizadas‚ÄĚ, explic√≥ Garc√≠a-Pag√°n.

La identificación de mutaciones hematológicas clásicas como JAK2V617F o calreticulina (CALR) representó un avance importante en el diagnóstico de TEV, sin embargo, algunos pacientes con NMP muestran negatividad para estas mutaciones, siendo necesaria para su diagnóstico una biopsia de médula ósea.

La técnica permite el análisis de secuenciación masiva de ADN, siendo capaz de analizar simultáneamente millones de fragmentos con alta sensibilidad incluso con una carga mutacional muy baja. En este trabajo se ha analizado el ADN de 75 pacientes con TEV idiopática / factor local aislado exclusivo y de 5 pacientes con NMP diagnosticados por biopsia espinal mediante un panel de NGS.

En ninguno de estos pacientes se habían detectado las mutaciones características de MPN, como mutaciones en JAK2 (V617F y en Exón 12), CALR o MPL mediante técnicas moleculares clásicas. Asimismo, la técnica NGS permitió la detección de tres pacientes con una mutación en el exón 12 de JAK2 con niveles mutacionales por debajo del 10%, que no se pudieron detectar con las técnicas de secuenciación convencionales.

Adem√°s de estas mutaciones cl√°sicas, NGS detect√≥, en un tercio de los pacientes, mutaciones en otros genes como ASXL1, DNMT3A y TET2, que recientemente se han agrupado bajo el t√©rmino ‘CHIP’ y que se han relacionado con patolog√≠a mieloide y / o estados proinflamatorios. Adem√°s, cabe mencionar que aquellos pacientes portadores de estas mutaciones ten√≠an un mayor riesgo de desarrollar un nuevo episodio de trombosis espl√°cnica durante el seguimiento ‚ÄĚ, Magaz dijo, para conformarse con asegurar que la t√©cnica podr√≠a ser √ļtil para mejorar el diagn√≥stico de trombosis venosas espl√°cnicas y el manejo de los pacientes con la enfermedad.



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