Un estudio advierte que el virus tiene «más éxito» en la propagación

Un estudio advierte que el virus tiene «más éxito» en la propagación

octubre 29, 2020 0 Por RenzoC


Investigadores y estudiantes de la Universidad de Illinois (Estados Unidos) han demostrado que el virus COVID-19 está perfeccionando las tácticas que pueden hacerlo más exitoso y más estable en su replicación y propagación.

En su trabajo, publicado en la revista Evolutionary Bioinformatics, los investigadores rastrearon la tasa de mutación en el proteoma del virus (la colección de proteínas codificadas por material genético) a lo largo del tiempo, comenzando con el primer genoma del SARS-CoV. 2 lanzado en enero y terminando con más de 15,300 genomas más tarde en mayo.

El equipo descubrió que algunas regiones todavía están produciendo activamente nuevas mutaciones, lo que indica una adaptación continua al entorno del huésped. Pero la tasa de mutación en otras regiones mostró signos de desaceleración y fusión alrededor de versiones únicas de proteínas clave.

«Esas son malas noticias. El virus está cambiando y cambiando, pero guarda para sí las cosas que son más útiles o interesantes», explica el autor principal del estudio, Gustavo Caetano-Anolles, profesor de bioinformática en el Departamento de Cultivos de Illinois. Ciencias.

Sin embargo, estabilizar ciertas proteínas podría ser una buena noticia para el tratamiento. “Al desarrollar una vacuna, por ejemplo, es necesario saber a qué se unen los anticuerpos. Las nuevas mutaciones podrían cambiarlo todo, incluida la forma en que se construyen las proteínas y su forma. Un objetivo de anticuerpo podría ir desde la superficie de una proteína para plegarse hacia adentro y ya no se puede alcanzar. Saber qué proteínas y estructuras se pegan proporcionará información importante para las vacunas y otras terapias ”, detalla otro de los autores, Tre Tomaszewski.

El equipo de investigación documentó una desaceleración general en la tasa de mutación del virus a partir de abril, después de un período inicial de cambios rápidos. Esto incluyó la estabilización dentro de la proteína de pico, los apéndices que dan a los coronavirus su apariencia coronada.

Dentro del pico, los investigadores encontraron que un aminoácido en el sitio 614 fue reemplazado por otro (del ácido aspártico a la glicina), una mutación que se apoderó de toda la población del virus durante marzo y abril. “El pico era una proteína completamente diferente al principio de lo que es ahora. Difícilmente se puede encontrar esa versión inicial ahora ”, dice Tomaszewski.

La proteína de pico, que está organizada en dos dominios principales, es responsable de adherirse a las células humanas y ayudar a inyectar el material genético del virus, ARN, en ellas para su replicación. La mutación 614 rompe un vínculo importante entre los diversos dominios y subunidades de la proteína de pico.

“Por la razón que sea, esto debería ayudar al virus a aumentar su propagación e infectividad al ingresar al huésped. De lo contrario, la mutación no se mantendría ”, dice Caetano-Anolles.

La mutación 614 se asoció con un aumento de la carga viral y una mayor infectividad en un estudio anterior, sin efecto sobre la gravedad de la enfermedad. Sin embargo, en otro estudio, la mutación se asoció con mayores tasas de mortalidad. Tomaszewski señala que, aunque su papel en la virulencia necesita confirmación, la mutación media claramente la entrada en las células huésped y, por lo tanto, es fundamental para comprender la transmisión y propagación del virus.

Sorprendentemente, los sitios dentro de otras dos proteínas relevantes también se volvieron más estables a partir de abril, incluida la proteína polimerasa NSP12, que duplica el ARN, y la proteína helicasa NSP13, que fija cadenas de ARN duplicadas. “Las tres mutaciones parecen estar coordinadas entre sí. Están en moléculas diferentes, pero siguen el mismo proceso evolutivo”, agrega Caetano-Anolles.

Los investigadores también notaron que las regiones del proteoma del virus se vuelven más variables con el tiempo, lo que, según dicen, puede dar una indicación de qué esperar a continuación con COVID-19. Específicamente, encontraron mutaciones crecientes en la proteína de la nucleocápside, que empaqueta el ARN del virus después de ingresar a una célula huésped, y en la proteína viroporina 3a, que crea poros en las células huésped para facilitar la liberación, replicación y virulencia del virus. .

Estas son regiones a tener en cuenta, dice el equipo de investigación, porque la mayor variabilidad no aleatoria de estas proteínas sugiere que el virus está buscando activamente formas de mejorar su propagación. Caetano-Anolles explica que estas dos proteínas interfieren con la forma en que nuestros cuerpos luchan contra el virus. Son los principales bloqueadores de la vía del interferón beta que forman nuestras defensas antivirales. Su mutación podría explicar las respuestas inmunes incontroladas responsables de tantas muertes por COVID-19.





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